OTU 及物種注釋

一、以核酸為基礎的微生物研究

儘管藉由培養技術能深入探討微生物的種類、型態及功能，但其缺點包含：（1）操作繁複導致無法檢驗大量樣本，（2）研究範圍限於可培養的微生物，（3）無法觀察微生物於環境中的表現。所以為了全面研究微生物的生態系統，仍有必要仰賴基於核酸的微生物研究技術。

Nature Medicine: 嬰兒共生菌相的成熟過程及其與分娩方式的關聯

人類的共生菌不僅協調內分泌、免疫和代謝機能，也參與這些器官系統的發育，失衡的菌落往往和疾病相關。因此，想要理解宿主怎麼和微生物發展共生關係並保持健康或導致疾病，就需要更深入理解微生物在宿主身上的建立過程。

β 多樣性（beta diversity）的含意與指標

一、β 多樣性的含意

α 多樣性是群集內的物種歧異程度，而 β 多樣性則是群集間的物種歧異程度。β 多樣性常用於描述群集在不同環境或干擾前後的差異，群集隨時間或其他環境因子的梯度變化，或是檢驗樣本間的重複性。由於微生物研究涉及很多樣本和物種，在計算樣本間的 β 多樣性後，通常會以 PCA、PCoA、NMDS 等排序方法進一步分析並繪圖呈現以利理解。這些研究項目意在釐清外在因素對群集結構的影響，所以良好的指標有助於研究者從觀察中發現模式，繼而提出假說並檢驗之。

發展多樣性指標的用意

一、發展多樣性指標的用意

多樣性指標不只是評估生態保育的依據，也是許多生態理論的參數。在 metagenomics 研究中普遍應用於描述不同生態條件下微生物群集的相似、差異、轉變與重複性。以人體共生菌的研究為例，研究者想要知道常人和病患的菌相差異、抗生素對腸道菌相的影響以及新生兒共生菌的建立模式與機制，這些研究議題涉及了不同實驗組別和不同時間點的樣本微生物相比較，然而比較的前提是存在描述微生物群集的方式。

α多樣性（alpha diversity）的含意與指標

一、物種豐富度指標（Species richness index）

物種豐富度是指群集含括的物種數目，通常研究者無法採集到群集中所有個體，所以只能從樣本推估母體的物種數。既有的方法包含曲線配適法（curve fitting）、參數法（parametric approach）和無參數法（non-parametric approach）

解開生命之謎：運用量子生物學，揭開生命起源與真相的前衛科學

英文書名（life on the edge）比中文書名更能反映作者的生物觀點。無機物和生命體在肉眼可見的範圍皆遵循牛頓力學，但其差異在於部分粒子的變動能否影響整體的行為。無機物的特性（熱漲冷縮、結晶、……）源於數量龐大的粒子分攤掉個別粒子的隨機特性，因此個別粒子無法影響整體。但是生命卻可以營造合宜環境，隔離或駕馭不規則擾動，保持個別粒子的特性，進而擴增到整個生命體驅動大大小小的反應，而這種特性可以用量子力學描述。換句話說，生命是在量子力學或古典力學支配的兩種秩序中間的微妙平衡，死亡意味著這平衡被打破，喪失微觀秩序和巨觀秩序的連結。

知識內容寫作課：寫一篇真材實料的網路爆紅好文章

這本書意在指引專家學者撰寫科普文章以發揮他們的知識影響力。作者強調科學溝通的必要性後，提供了爆紅文章的架構與撰寫流程，接著解釋這些文章引人注目的要素，並且從泛科學網站的文章瀏覽資料中彙整出熱門主題供讀者參考。最末兩章聚焦行銷與傳播，講述如何從寫文推廣到建立個人知識品牌。