Trimmomatic 裁切功能簡介以及比對方式的疑問

裁切序列是 NGS 品質控管重要的一環，諸如建庫時添加的人工序列和序列末端品質低落的片段等都是要移除的目標。Trimmomatic 是專門用於 Illumina 定序資料的品管軟體，它可以發揮以下功能：

• 從 3' 端切除建庫時添加的人工序列

• 依照四種不同的模式裁切品質不佳的序列

• 依照平均定序品質分數篩選序列

本文著重 Trimmomatic 裁切功能的簡介與疑問。