PNAS:無膜的聚酯微滴在生命形成時可起隔離作用

Membraneless polyester microdroplets as primordial compartments at the origins of life
T.Z. Jia et al. (2019)

無膜的聚酯微滴可以在生命形成時發揮隔離功能

前陣子我參加了中研院生物多樣性中心舉辦的小型演講,在場的聽眾不多,但討論挺熱絡的。講者是東京工業大學地球生命科學研究所 (Early Life Science Institue, ELSI) 的 Dr. Tony Z. Jia ,他在介紹近期的研究之餘,也梳理了數十年來生命起源問題的研究脈絡。

To our Prof. Ovenden:我與《宇宙中的生命》


Life in the Universe by Michael W. Ovenden (1962)

此書於一九六零年代出版,那時太空計畫才剛開始,望遠鏡技術也不若今日進步。書中的天文學知識多半過時,例如作者寫到火星時,還認真討論起火星高等生物的模樣。不過隨著海盜號任務傳回的清晰影像,我們已經認知到火星表面是了無生機的世界。


Nature:TEDDY 計畫之嬰幼童早期腸道菌相的逐月發育

Temporal development of the gut microbiome in early childhood from the TEDDY study


大樣本、長時間、多中心研究描繪了嬰幼兒四歲前腸道菌相的發育軌跡和與之相關的外在因素。

16S rRNA 定序文庫製備

相較於培養方法,基於 16S rRNA 標識基因的微生物研究既能批次處理大量資料,也能研究難以培養的菌種。此外,由於僅定序微生物基因體的一部份,其成本也較全總基因體定序 (shotgun metagenomic sequencing) 低,能在研究初期先勾勒出目標環境的物種組成,再由結果判斷值得探究的對象,進而以轉錄體、全總基因體或蛋白質體技術等成本較高的技術深究之。

如何成為天文生物學家?

To live, to err, to fall, to triumph, to recreate life out of life!  (去生活,去犯錯,去跌倒,去勝利,去在生命中創造生命)

― James Joyce, A Portrait of the Artist as a Young Man

申請全戶財產與所得資料

為了有效分配資源,高額獎學金通常會要求申請者附上家庭所得與財產資料。由於申調財產所得資料所需的證件繁雜,網路上的心得分享也眾說紛紜,因此我想利用這篇文章釐清申請財產與所得資料的流程以及需準備的證件。

Linux|SSH 原理以及遠端登入伺服器

本文將簡介 SSH 網路傳輸協議的加密原理並說明以 PuTTY 從 windows 作業系統遠端登入 Linux 伺服器的方法和個人化設定。

億萬年的孤獨:地外文明探尋史話


這本書首先依照時間順序介紹了搜索地外文明的小故事,接著探討費米悖論的內容以及相關解釋,最後以一篇科幻小說和作者對於地外文明的臆想作結。作者的目的是激起人們的好奇心,所以全書內容淺顯。另一方面作者也在段落間抒發個人意見,表達他對於科學家精神的看法

β 多樣性(beta diversity)的含意與指標

一、β 多樣性的含意


α 多樣性是群集內的物種歧異程度,而 β 多樣性則是群集間的物種歧異程度。β 多樣性常用於描述群集在不同環境或干擾前後的差異,群集隨時間或其他環境因子的梯度變化,或是檢驗樣本間的重複性。由於微生物研究涉及很多樣本和物種,在計算樣本間的 β 多樣性後,通常會以 PCA、PCoA、NMDS 等排序方法進一步分析並繪圖呈現以利理解。這些研究項目意在釐清外在因素對群集結構的影響,所以良好的指標有助於研究者從觀察中發現模式,繼而提出假說並檢驗之。


α多樣性(alpha diversity)的含意與指標


一、物種豐富度指標(Species richness index)


物種豐富度是指群集含括的物種數目,通常研究者無法採集到群集中所有個體,所以只能從樣本推估母體的物種數。既有的方法包含曲線配適法(curve fitting)、參數法(parametric approach)和無參數法(non-parametric approach)
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