DIABIMMUNE Microbiome Project 資料簡介

DIABIMMUNE Microbiome Project,  https://pubs.broadinstitute.org/diabimmune
儘管許多研究探討腸道微生物群落的建立過程,但這些研究的資料未必開放使用。為了研究飲食與腸道微生物發育的關係,我在 NCBI SRA database 還有 EMBL-EBI MGnify 以嬰兒(infant)、腸道 (gut)、微生物 (microbiome) 等關鍵字搜尋適合的數據。雖然 DIABIMMUNE Microbiome Project 提供的資料在數據類型、樣本規模和飲食記錄等條件上非最佳選擇,但它卻開放使用。本文簡介此計畫的研究目的還有資料特性,供往後欲使用此數據的研究者參考。

PNAS:無膜的聚酯微滴在生命形成時可起隔離作用

Membraneless polyester microdroplets as primordial compartments at the origins of life
T.Z. Jia et al. (2019)

無膜的聚酯微滴可以在生命形成時發揮隔離功能

前陣子我參加了中研院生物多樣性中心舉辦的小型演講,在場的聽眾不多,但討論挺熱絡的。講者是東京工業大學地球生命科學研究所 (Early Life Science Institue, ELSI) 的 Dr. Tony Z. Jia ,他在介紹近期的研究之餘,也梳理了數十年來生命起源問題的研究脈絡。

16S rRNA 定序文庫製備

相較於培養方法,基於 16S rRNA 標識基因的微生物研究既能批次處理大量資料,也能研究難以培養的菌種。此外,由於僅定序微生物基因體的一部份,其成本也較全總基因體定序 (shotgun metagenomic sequencing) 低,能在研究初期先勾勒出目標環境的物種組成,再由結果判斷值得探究的對象,進而以轉錄體、全總基因體或蛋白質體技術等成本較高的技術深究之。

如何成為天文生物學家?

To live, to err, to fall, to triumph, to recreate life out of life!  (去生活,去犯錯,去跌倒,去勝利,去在生命中創造生命)

― James Joyce, A Portrait of the Artist as a Young Man

申請全戶財產與所得資料

為了有效分配資源,高額獎學金通常會要求申請者附上家庭所得與財產資料。由於申調財產所得資料所需的證件繁雜,網路上的心得分享也眾說紛紜,因此我想利用這篇文章釐清申請財產與所得資料的流程以及需準備的證件。
Back to top