R 讀寫 FASTA 檔

先前曾介紹 R 讀取 FASTQ 檔的方式，本文則要分別介紹如何在 R 環境，使用 seqnir 套件或 baseR 讀取 FASTA 檔。

R 讀取 FASTQ 檔

R 的 ShortRead 套件用於處理高通量定序產出的 FASTQ 檔，其功能包含讀寫 FASTQ 檔、計算序列統計量、裁切與篩選低品質序列等。目前，ShortRead 被保留在 Bioconductor ，並由開發團隊持續更新與維護。